全てを失い、しかし彼は聖霊をしたがえて勇者になり返り咲く〜元勇者候補の少年の破壊劇〜

４００年前、人類は「謎の攻撃」により地上からの退去を余儀なくされた。各国はそれぞれ巨大な軍用飛行物体を用いて生き残った人々を天空に浮遊する「天の楽園シエル・イル」へと輸送する。

そこには見たことも無い生命体が多数存在し、聖霊と名付けられた。その聖霊を従えて共に歩む術を学ぶ聖霊遣いの学院「華々舞学院」に入学した少年たちは一般に秘匿された世界の秘密を知ることが出来、選ばれたもの以外は入学できないのだった。

三武朔夜は選ばれたうちの１人として学院に通い始める。彼はそこで聖霊の少女と出会い、自身の記憶を、彼女の過去を、世界の成り立ちを知ることとなる。