箱舟の聖痕（～人類が遺した宇宙船で生まれた少女と、それを統べる単一思念AIが紡ぐ、隠された世界の記憶〜）

「私は人間？ それとも、人間を模した機械なの――？」

太陽系を離れた人類は、地球の全遺伝子情報をデジタルデータ化（箱舟）して、大宇宙船で新天地へと絶望的な航海へと旅立った。

しかし、人類は新天地を到着する前に全滅。
残された宇宙船を統括していた単一思念AIが『箱舟』を託されたのだが、非情な決断を迫られる――。

それから数万年後、ひとつの奇跡が産声を上げた。
少女「エスペラ」は、生身の肉体弱点を克服した究極の機械細胞をもって生まれた。
空気も水もいらない己の肉体に恐怖し、孤独にへたり込む彼女の前に現れたのは、1体のドローンだった。

凍てつく幽霊船を舞台に、人類を再創造させるべくエスペラとドローンの旅がはじまる。