主人公の妹を寝取ろうとするエロゲーの悪役に転生した俺は破滅フラグを回避するため真っ当に生きようとしたが、なぜか妹は俺に好意を寄せている。

恋愛シミュレーションゲーム『妹と紡ぐ恋の旋律』。プレイヤーは妹である篠宮綾乃の兄となり、妹や他のヒロインたちと心を通わせていくという物語が展開される。しかし、このゲームには数々の問題点があった。

兄である篠宮悠斗は妹に対して鈍感で、高圧的な態度を取ることが多い。そのため、妹の好感度が低いままストーリーが進むと、彼女は心を閉ざしてバッドエンドへ一直線。また、他の準ヒロインたちも妹をライバル視して嫌がらせをする展開が多く、見ていて胸が痛むシーンが連発する。

そんなゲームの世界に、プレイヤーだった俺がまさかの悪役である城咲玲司として転生してしまった！

悪役の立場である俺は、綾乃を悠斗から寝取ろうとして破滅する未来が待っている……はずだったが、そんなものはまっぴらごめん！ ゲームをやり込んだ知識を活かし、破滅フラグを回避するため真っ当に生きようと決意するが、何故か綾乃は悠斗ではなく俺に好意を寄せ始めていた。