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2050年、日本国は第4次世界大戦に敗れ、西日本は軍事企業連合、『フロンティア』に支配されていた。
サイボーグ技術の発展に帰依した富樫博士の娘、ジェシカ・富樫はフロンティアの特殊化学戦警察機構軍、通称Specialsに配属され、軍事アンドロイド、谷口士郎の部下となり、旧日本軍残党のテロリストと対峙する。