糸をたどり君を紡ぐ。

天才的な頭脳を持つ高校生の俺、吉川春道は、退屈な日常にうんざりしていた。そんな俺の心を唯一掴んだのは、心を読めないミステリアスなクラスメイト、月浦美咲だけ。彼女が熱心に読んでいた本に載っていた、名もなき百姓が祀られる神社の謎を追ううちに、俺は戦国時代へとタイムスリップしてしまう。

そこで出会ったのは、月浦美咲に瓜二つの百姓の娘。カナ。そして、未来で「神」として祀られることになる、彼女の兄、月兵衛だった。

俺の天才的な知識と、月兵衛の武勇が交差する時、歴史の歯車は狂い始める。教科書にはない、もう一つの「歴史」を紡ぎ始めた俺は、「史実」と「彼女」との間で葛藤する。