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プロローグ
日本の少子高齢化に伴う人口減少を解決するため。少数の政治家により秘密裏にプロジェクトが始動された。そのプロジェクトはいくつかの項目に分けられ進められることになった。
第ー段階は子供を産める健康な身体の親を確保すること。
第二段階は子供を産むための環境作り。これらの準備を手始めに始めた。
第三段階は学習するための環境作りが行われた。
優秀な人間を育成するために、優秀な人間数名を教師に選んだ。
そして、第四段階は生まれてきた子供が自我を持ち始めた頃から、男女ー組で生活させることである。
この物語は主人公櫻井遥乃がカリキュラムを修了してから施設クライム・タワーで教師の経験を積み、上からの命令で学校へ通い生徒たちを教育する物語。櫻井は生徒たちから何を学ぶのか。