魔法少女？いえ魔法少年です。

現実世界において魔法は女性の独壇場である。裏社会として存在している魔法ネットワーク。両性とも魔法を使うことは可能だが男性よりも女性の方が強いというのはもはや常識であった。その一因として魔法少女が存在している。精霊と契約した彼女達が振るう力は絶対的である。どんなに絶望的な災害にも対応する彼女達は裏世界に置いてトップとされていた。
だが、今や精霊は人工的に契約する存在となっていた。魔法少女も、人工的なものであった。
そんな時に出現したのは坂原愛里寿。彼女は天然の魔法少女であった。そして、そんな彼女と共に突如頭角を現した相川春樹。彼は本来なら女性しかなれないはずの魔法少女であった。
２人はやがて。裏世界の学校に入学し、様々な思惑に絡まれていくことになる。