A・LAMP－A1地区特殊機動隊－

2038年1月、某国の奇襲から第四次世界大戦が勃発した。核攻撃の応酬により戦争はわずか2年で終結したが、人口は8分の1までに減少し、大陸は放射能に汚染された。第三次世界大戦から300年経った2380年、人々は地下に超巨大地下都市「ハナゾノ」を創り、そこに住み始めたのであった。
人々が移り住んでから200年経った2580年。A1地区特殊機動隊A・LAMP(エンゼルランプ)の若き部隊長ケイ・ヴィレットは家族でありライバルのタイト・皇らとともにテロリストの制圧を行っていた。
基地内部を捜査中にケイとタイトは少女の声に導かれ「極秘生命体管理室」と書かれた部屋に入ってしまう。そこで目にしたのは肉塊と化した人々と鎖に繋がれた片翼の少女だった。この出会いで、彼は何者かの陰謀の中に引きずり込まれたことをこの時はまだ、少女しか知らなかった。
信念のため、世界のため、A・LAMPの少女を護る戦いの幕が上がる。