黒に染まる君に言いたいことがあるんだ。

ある日突然体の至る所が黒く腐敗する謎の奇病、黒死病が発見され主人公の住む相生に隔離、研究、治療を目的としたサナトリウムが建設される。人生に鬱屈としている少年霧島ナツキは休日の日課であるギターの演奏をするため向かったサナトリウムの隣に建設された公園で、少女榛名彩音と出会う。