魔学再生　～魔法にあふれたこの世界で生き抜くためには、やっぱり魔法が必要です。え、直剣二本じゃダメ？～

宇宙の彼方で「マナ」が誕生し、従来の法則は根底から覆った。
科学に依存していた文明は崩壊し、地球は新たな進化を余儀なくされた。

「マナ」は人の内面、感情に応じて力を引き出し、それを「魔法」として具現化する。この魔法を操る「魔法使い」は、人類の新たな希望となり、その力で未来を切り拓いた。
「マナ」によって破壊された世界は、同時に「マナ」によって再生を果たすに至る。

激動の時代を経た地球はようやく安定を取り戻し、人々は失われた日常を再び手に入れつつある中、世界では魔法使いの育成が急務とされていた。

・・・

魔法使いになることが当然のように語られる時代。
橘灰利（タチバナ ハイリ）は流されるように魔法使いを目指していたが、実際には兄の存在だけが誇りだった。兄は「世界最高の魔工学者」として名を馳せる人物だったが、ある日突然失踪。灰利は目標を失い、無気力な日々を送る。
そんな中、兄から荷物が届く。そこには二振りの剣と、世界唯一の魔法使い育成機関「ノークティック魔法学園」の入学許可証が同封されていた。

兄の行方を追うため、そして今の自分を変えるため、灰利は学園の門をくぐるのだった。