僕は祓魔士で巫女ちゃんを守りたい

人に害を与える妖怪や悪魔などを人は魔と呼ぶ。
魔を監視.排除する組織─それが祓魔機関。
その祓魔機関に所属する祓魔士の総司は、長官の指令を受け、幼女に見える美少女、那美と共に、暮らすことになった。
世話好きの総司と、ドジ幼女の那美のお似合いコンビが始まる。
しかし、那美は少し特異な体質なようで───