浸食されるこの世界で

　魔法を扱うことができる『魔術師』達は二川市を中心に市民を殺害していた。それを阻むかのように同じく魔法を扱う少女、『紅眼の魔術師』が彼らと戦っていた。

　抜群の学力と武力で、警察学校を首席で卒業した警察官、藤元賢太郎（ふじもと けんたろう）は魔術師対策班の加入を任命され、彼らから市民を守るために奮闘しようとしていた。

　勉強もスポーツもできず、自分には何ができるのかを悩んでいる中学二年生の少女、相原優未（あいはら ゆみ）は唯一の親友、菅田真希（かんだ まき）と共に中学生生活を送っていたが、とある事件をきっかけにその日常が大きく変わることになる。