超有限学園都市生活……いや、計画。

　中瀬アスカは両親を事故でなくし、年の離れた従兄にとある条件で引き取ってもらうことになる。
　それは女子寮に暮らし女子高生として生活することだった。

　到着したその日に偶然鉢合わせてしまった同じ寮に住む弘田ミチホと、何故か瞬時に男であることを見抜いてきた天谷サクラコに協力してもらい、絶対に男だとバレてはいけない新たな高校生活がアスカを待っていた。

　学園都市『冬檻』にある『冠星学園』に転校したアスカは、二学期の始業式で意味深な映像を見せられる。
　そして、アスカを女子として生活させる従兄の目的や、『凍棺学園』に在籍する朝日キノカに命を狙われる事件など、アスカの学園生活は思わぬ方へと転がり落ちていく。

　不可思議が蔓延る学園都市の裏で着々と進行される謎の計画、次々と生徒を巻き込んでアスカが行き着いた先に待っている真実とは。