第６１章 ペプチド（１）
第６１章 ペプチド（１）
第１話 謝罪
「申し訳ありません」
「記述言語」について、記述する事が出来なくなりました。
理由は、他のサイトで「本」として、売る事にしたためです。
そして、その理由は、僕が働きに家の外に出る事が出来なくなったためです。
何らかの契機で、身体に痙攣が起こるようになりました。
お医者さんから「ドクター・ストップ」が、かかりました。
そこで、ネット上で、ストレスのかからない生活方法を模索する事になりました。
その１つが「本」です。
（来週の水曜日に診断結果が出ます）
値段は、１冊（３，０００文字）１０円を目途に販売しようと思っています。
プログラム・ソースは、３００円くらいにしようと思っています。
販売予定は７～１０日後ぐらいが、目標です。
その間に、TSPの解法のプログラム作成とベンチを行いたいと思います。
この小説サイトは、全てが「趣味と心の栄養」です。
なので、記述言語以外は、続けたいと思います。
第２話 ペプチド（６）
始めに！気になっていた引用の仕方が分かりました。
引用した記述の最初か、最後に出典元を明示すれば、いいのだそうです。
例えば、URLとか。
伸長について学びます。
① P部位にｆMet-tRNAが結合すると、７０ｓ開始複合体のA部位には開始コドンの隣のコドンと
対合するアンチコドンを持つｔRNA分子が結合できるようになります。
② A部位にアシル化ｔRNAが結合すると、ペプチジルトランスフェラーゼとよばれる酵素複合体
（７０ｓリボソーム自体が持っている活性）によってN‐ホルミルメチオニンと
ｔRNAに結合したアミノ酸との間にペプチド結合が形成されます。
③ その際にN‐ホルミルメチオニンにはP部位のｆMet-tRNAから切離されます。
ここでリボソーム上では、
１）アミノ酸を放したP部位のｔRNAはこの部位を離れる。
２）ペプチジル‐ｔRNAがA部位からP部位に移動する。
３）ｍRNAが３塩基分の距離だけ移動し、A部位には次のコドンが現れる。
という3種類の動きがみられます。
２）、３）の動きをトランスロケーションと呼びます。
④ ｍRNAの移動が起きるとA部位に次のコドンに対応するアンチコドンをもつ
アシル化‐ｔRNA分子が結合し、上記の過程が繰り返されてペプチド鎖が次々に長くなります。
用語の調査を行わなければ、何を言っているのか？全く理解出来ません。
・アンチコドン：コドンの論理否定と同じようです。
DNAは、A、T、G、Cの塩基の組み合わせです。
RNAは、A、U、G、Cの塩基の組み合わせです。
そして、この塩基を３つ組み合わせてコドンを作ります。
ここまでは、前章までで学びました。
塩基には、必ず対になる塩基があるそうです。
DNAでは、AとT、GとCが対になるそうです。
RNAでは、AとU、GとCが対になるそうです。
対と言う表現を使っていますが、僕は「真偽」の関係に置き換えました。
概念的には、筋道が通ると思います。
例えば「AGC」というコドンが有った時、アンチコドンは否定の「TCG」となります。
つまり「自然の法則により、自分とペアになる姿を探して結合する」という事かな？
・アシル化ｔRNA、ペプチジルトランスフェラーゼ：この２種類の用語は一組とした方が、
理解し易いと思います。１つのα－アミノ酸には、１つの酵素が対応するようです。
つまり、１対１です。酵素の事を「ペプチジルトランスフェラーゼ」ではなく、
「アミノアシルtRNAシンセテース」と説明している情報もありました。
結論として、①と②は「アンチコドンと１対１酵素によって、特定的にペプチド結合を行う」
と、言う手順の説明だと解釈します。
・ｆMet-tRNA：開始RNA（おそらくコドンの事）の事だそうです。しかし、その開始が絶対的な
開始部分なのか？アクティブ（現在の位置）な開始部分なのか？の説明が見つかりませんでした。
説明の流れから予測すると、アクティブな開始部分だと思います。
・ペプチジル‐ｔRNA：tRNAの状態の一形態になるようです。
概略を掴むためには、これ以上は、深入りしません。
③は、コンピュータで言えば、コード・ポインタの移動の説明だと思います。
つまり、１つ命令の処理が終わって次の命令を処理しようとする経過の説明だと思います。
tRNAは複数の順番に並んだコドン（命令）から形成されています。①～③は、その中の
１つのコドン命令について記述しているものと思われます。
④は「①～③を終了コドンまで、繰り返しますよ」と、言っているのだと思われます。
コドン＝命令の意味は「１つのアミノ酸を繋げる」事です。
用語を調べ終わると、調べる意味が薄かった感じがします。
結論として「伸長とは、tRNAに従ってアミノ酸を繋げる事である」とします。
以下は、メモです。
・A部位：アミノアシルtRNAの結合
・P部位：ペプチド結合の形成とtRNAの離脱
・E部位：ポリペプチド鎖から解放されたtRNAの結合
