天国ライフ？いや異世界転生でしょ！

病気で亡くなった高校生の桜川みなせは、天国に最も近い聖域『アルペジオ』で黒服を着た青年バトラと少女アルフレッドに出会う。彼らは死人を天国へと誘う天国入国管理局に所属する役人で、みなせを天国まで案内する。

天国『調和奏でる街リボン』に降り立ったみなせは、亡くなったはずの祖父・智和と再会する。みなせは智和から天国について色々と教わった後、彼の提案で異世界に行くことを決意する。
しかし、異世界へ行くには女神アテナからの神託を受ける必要があり、みなせは女神アテナがいる場所『エタニティ』へと向かう。行く先々で知人や史人などと出会い、様々なトラブルに巻き込まれながらも、みなせは異世界転生という目的を果たすため旅を続ける。