古代戦艦クルクス　～呪われた女教王の祈り～

とあるカトリック修道会が発足した都市型船団クルクス(通称戦艦クルクス)は、地球を発ってから七百年ものあいだ宇宙を孤独に彷徨っていたが、ある日突然目にみえぬ敵に襲撃される。

立ち向かうのは女教王ティラナと、その双子の弟である准王シルヴィオ。そしてふたりのクローン、エレナとレオナルド。クルクスの王家である彼らはふたり一組で戦闘機に乗り、民衆を護るため、宇宙に出て命懸けで闘う。

しかし一方、政府や修道星庁のなかの不審な動きが四人の行く手を阻むようになった。みえぬ謎の敵と、内部のオトナと……、十六歳の彼らは次第に苦しめられていく。

それぞれが秘めている禁断の恋、四人の出生の秘密、また戦艦の歴史が明らかになるとき、彼らの祈りは神に届くのか。