幕末
九代藩主・建部政和は建部政醇の子。嘉永四年（1851年）に河野鉄兜を招聘した。鉄兜は文政八年（1825年）に医者の子として生まれた。五歳から漢籍を学ぶ。一五歳で一夜にして詩百篇を作り、神童と呼ばれた。本屋では立ち読みで内容を覚えてしまい、本を買わなかった。そのため、本屋の店主は鉄兜が来ると新刊書を隠した。
その後、上洛して梁川星巌について詩を学ぶ。松本奎堂や頼三樹三郎らの勤王の志士と交わった。本草学、仏教、絵画、和歌にも通じ、博学多能で知られた。
林田藩の招聘に際して鉄兜は「西国の高名な文人達と交流したいので、旅行のための休暇をいただきたい」との条件を付けた。政和は承諾して旅行費用も出した。
林田に居を移した鉄兜は嘉永五年（1852年）、二八歳で林田藩に仕官した。藩校致道館の教授になり、尊王攘夷を説いた。全国から多くの志士・文人・学者が河野に会うために林田を訪れた。
政和は安政三年（1857年）、大番頭となり二条城を警備した。文久三年（1863年）に詰めていた二条城で亡くなった。
幕末には林田藩から勤皇の志士として大高又次郎と大高忠兵衛の兄弟が登場した。大高家は「大高製の皮具足」と呼ばれる皮具足の製法で有名であった。赤穂四十七士の一人・大高忠雄の子孫を称した。
大高又次郎は文政四年（1821年）に甲冑職人・大高六八郎義郷の子として生まれる。忠兵衛は文政六年（1823年）に林田藩郷士・常城広介の次男として生まれる。一四歳の時に大高義郷の養子となる。兄弟は甲州流軍学や西洋砲術、勤皇思想を学び、各地の志士達と交流を深めた。
忠兵衛は嘉永元年（1848年）に上洛。衣棚押小路入下妙覚寺町で甲冑商「大鷹屋」を営みつつ、政治活動に奔走する。又次郎は安政五年（1858年）に脱藩。梅田雲浜宅に住み、梅田雲浜や頼三樹三郎らの志士と交流した。この年に井伊直弼が大老に就任した。
安政六年に萩へ行き、吉田松陰と会談した。安政の大獄で梅田が捕らえられ、それを追って江戸に潜伏した。梅田が処刑され、自らにも幕府の追捕が迫ったため、浅草寺で坊主に変装して江戸を脱出し、京都の長州藩邸に逃げ込む。兄弟は勤皇の志士としても武具・兵器の調達を担当した。
又次郎と忠兵衛は元治元年（1864年）6月5日、池田屋事件に遭遇する。二人は池田屋で尊王攘夷派の会合に参加した。会合の目的は、新選組に逮捕監禁された仲間の古高俊太郎を救うことである。京都大火計画は新選組による捏造であり、実力行使を正当化するための冤罪であった。
会合中に新撰組の近藤勇、沖田総司、永倉新八、藤堂平助が襲撃した。又次郎は奮戦むなしく新選組によって討たれた。忠兵衛は一旦脱出したが、捕縛された。事件後の6月7日、大高家は新選組の家宅捜索を受ける。妻とみ、子ども6人、門弟2人らは捕らえられたが、長男の幸一郎は鳥取へ逃げ延びた。7月4日に忠兵衛は六角牢で獄死した。
十代藩主・建部政世は建部政和の長男として誕生した。祖父の建部政醇の三男とされ、兄・政和（実は父）の養嗣子となった。文久三年（1863年）4月18日に藩主になる。
徳川慶喜は慶応三年（1867年）10月14日に大政奉還を奏上した。12月9日に王政復古派公卿が集まり、王政復古の大号令が出される。その日の夜に小御所会議が行われ、徳川慶喜の官位（内大臣）辞退と徳川領の削封（辞官納地）が決定された。王政復古のクーデターである。
政世は12月20日に上洛し、新政府に恭順した。ここには林田藩の宗家と言うべき備前岡山藩との連携がある。慶応四年（1868年）1月3日に鳥羽伏見の戦いが勃発する。戊辰戦争の初戦である。旧幕府軍が兵数において優勢であったが、指揮命令が統一されておらず、薩摩藩と長州藩の軍勢に敗北した。
林田藩は新政府から1月15日、華頂宮博経親王の警備を命じられた。博経親王は伏見宮邦家親王第十二王子であるが、万延元年（1860年）8月に孝明天皇の猶子となり、同年11月に親王宣下を受けた。
新政府は鳥羽伏見の戦いを幕府軍として戦った姫路藩を朝敵とし、林田藩にも姫路城攻略を命じた。姫路城は元々、林田藩の宗家ともいうべき池田家の城であった。その城を攻撃する立場になるとは林田藩にとって不思議な感がある。姫路城接収の主力は備前藩池田家である。池田家の幕下で戦うという建部家の伝統は幕末まで貫徹された。
姫路藩主の酒井忠惇は老中を務め、将軍徳川慶喜に従って大阪城に入った。姫路藩は井伊直弼の暗殺で凋落した彦根藩に代わって幕府を支えていた。慶喜は鳥羽伏見の敗戦後の1月6日に大阪城を退去し、大坂湾に停泊中の幕府軍艦開陽丸で江戸に退却した。そこに酒井忠惇も同行した。藩主不在の姫路藩では家臣によって1月17日に無血開城された。
林田藩は1871年（明治4年）4月の廃藩置県で林田県となる。11月2日に姫路県に統合され、11月9日に播磨県に改称される。1876年（明治9年）に兵庫県に合併し、兵庫県揖保郡林田村となる。1955年（昭和30年）に林田村と伊勢村が合併して林田町になるが、姫路市に編入されて自治体としては消滅した。現在も姫路市林田町として地名は残っている。
