カッパが大好きなボクは、カッパになれない女の子と友達をすることになりました。

　カッパが好き過ぎて、カッパ研究の日々を送り、カッパをリスペクトするウェブサイトを主催する大学生・二木あるはのもとに、ある夜突然、カッパが訪ねてくる。そのカッパは亀ケ岡駿一郎と名乗り、亜麻月カノハという人間の少女と友達になって欲しい、と言った。
　亜麻月カノハも実はカッパなのだと聞かされ、カッパへの探求心を抑えられない二木あるは、友達になることを引き受けたのだが、亜麻月カノハのとんでもない行動とその能力に振り回されることになる。
　そして、その日が訪れ、二木あるはと亜麻月カノハは「二人の運命」を知らされることになる……