怪異の正体

　けっこうな田舎で暮らしている中学三年生の楠田慎吾は理数系の得意な優等生である。その友人に野村祐介と鷲尾翼がいる。この三人は小学生の頃からの親友で、各々、特技を持ついい男たちである。
　中学校の担任だった西園寺が家業のお寺を継ぐために先生をやめ、塾を開業した。楠田は西園寺を心の師として傾倒していたこともあって、その塾に二人を誘って行くことにする。
　ある時、その西園寺からの依頼でこの地域にまつわる怪異の謎を解くアルバイトを依頼される。高額バイト料につられて３人は参加する。
　楠田は【科学で解明できない謎はない】という考え方を持っており、怪異の謎を科学で解こうとする。一方、野村は怪異は存在するという考えを持っており、極端に怪異を怖がる。
　さらにこの謎解きに興味を持った楠田と同じ科学部の水元涼も謎解きに参加することになる。
　はたして楠田は怪異の謎を科学で解くことが出来るのか、そしてその怪異を解いた先に何が待っているのか。