遠き昔の七不思議

とある地方のとある進学校に、ある日転校生が来る。名前は三波花(みなみ はな)。高校二年の正一(しょういち)、源二(げんじ)と同じ六組に入ることになった。
三波は人当たりが良く、すぐに三人は仲良くなり、『ひふみトリオ』と呼ばれるようになった。

その夏のことである。この高校近くのどこかに、過去に戻れる穴がある、という噂が三人の耳に飛び込んできた。
その穴を探そうと言い出した三波の言葉をきっかけに、『ひふみトリオ』は捜索を開始した。

過去に戻れるその穴を起点にして、三人の関係は少しずつ変わっていく。