| 第０話 『プロローグ』 | 2010年 01月 13日 （改） |
| 第一話 『新入生歓迎会！？』 | 2010年 01月 14日 （改） |
| 第二話 『ヒロイン登場！？』 | 2010年 01月 14日 （改） |
| 第三話 『「融合」と「シンクロ」』 | 2010年 01月 15日 |
| 第四話 『ちびｖｓちび！？』 | 2010年 01月 16日 （改） |
| 第五話 『なぞの男、その名は「ＧＴ」』 | 2010年 01月 17日 （改） |
| 第六話 『充電池メン！？（前編）』 | 2010年 01月 19日 |
| 第七話 『充電池メン！？（後編）』 | 2010年 01月 22日 （改） |
| 第八話 『ｖｓオベリスクブルー！（前編） ３大デッキ！？』 | 2010年 01月 27日 （改） |
| 第九話 『ｖｓオベリスクブルー！（後編） 裁きの龍！？』 | 2010年 02月 03日 （改） |
| 第十話 『抽選デュエル！！』 | 2010年 02月 12日 |
| 第十一話 『謎の男、「ＧＴ」再び』 | 2010年 02月 18日 （改） |
| 番外編～ある日のできごと～ | 2010年 02月 22日 （改） |
| 第十二話 『一志ＶＳ見上先生！！（前編） 奪われた充電池メン』 | 2010年 02月 28日 （改） |
| 第十三話 『一志VS見上先生！！(後編) 選ばれし戦士！？』 | 2010年 03月 07日 （改） |
| 第十四話 『鰯田君の特訓！①』 | 2010年 03月 10日 |
| 第十五話 『鰯田君の特訓！②』 | 2010年 03月 17日 |
| 第十六話 『鰯田君の特訓！③』 | 2010年 03月 22日 |
| 第十七話 『鰯田君の特訓！④』 | 2010年 04月 03日 （改） |
| 第十八話 『鰯田君の特訓！⑤』 | 2010年 04月 10日 |
| 第十九話 『鰯田君の特訓！⑥』 | 2010年 04月 20日 （改） |
| 第二十話 『デュエル・アカデミア交流戦前日』 | 2010年 04月 26日 |
| 第二十一話 『デュエル・アカデミア交流戦開会式』 | 2010年 05月 08日 |
| 第二十二話 『イエロー対決！炎ＶＳ水』 | 2010年 05月 09日 |
| 第二十三話 『融合合戦？』 | 2010年 05月 16日 （改） |
| 第二十四話 『休憩時間でのひと時』 | 2010年 05月 24日 （改） |
| 第二十五話 『ブルー対決！合体召喚！？』 | 2010年 06月 05日 |
